La communauté est administrée par une association 1901 : l'association Emmaüs St-Gaudens, qui rassemble un certain nombre de membres.
Lors de l'assemblée générale ordinaire de l'association, les membres élisent le conseil d'administration de 6 à 21 membres, renouvelés par tiers tous les 3 ans.
Le conseil d'administration élit un bureau pour une durée d'un an.
L'association est régie par des statuts et un règlement intérieur.
Conseil d'administration élu en juin 2019 :
Les 5 premières personnes de la liste constituent le bureau.
La communauté est dirigée par :
- un responsable : Charles Imbert, qui organise, entre autre, le travail des compagnes, des compagnons et des bénévoles.
- un responsable adjoint : Ervin Kodra.
Ils assistent aux réunions de bureau et du conseil d'administration, sans droit de vote.
Emilia Teissié, secrétaire-comptable et Abderrahim Lagnaoui, agent technique chargé de la réparation des appareils ménagers, Catherine Piquemal, intervenante sociale et Mickaël Delattre, cuisinier complètent le personnel de l'association.